Sodium Dodecyl Sulfate-Polyacrylamide Gel Electrophoresis (SDS-PAGE) adalah salah satu teknik elektroforesis yang paling banyak digunakan untuk memisahkan protein berdasarkan berat molekulnya. Teknik ini menjadi metode standar dalam analisis protein karena kesederhanaannya, efisiensinya, dan kemampuannya menghasilkan data yang akurat.

Prinsip Dasar SDS-PAGE

SDS-PAGE bekerja dengan memanfaatkan sifat molekul SDS (Sodium Dodecyl Sulfate), yaitu deterjen anionik yang memiliki dua fungsi utama:

1. Denaturasi Protein
   SDS memecah struktur tiga dimensi protein, menghilangkan lipatan dan membentuk rantai polipeptida linier.
2. Memberikan Muatan Negatif
   SDS melapisi protein dengan muatan negatif yang proporsional terhadap panjang rantai polipeptida. Akibatnya, muatan asli protein menjadi tidak relevan, sehingga pemisahan hanya didasarkan pada berat molekul.

Setelah protein didenaturasi dengan SDS, sampel protein dimuat ke dalam gel poliakrilamida. Ketika arus listrik diterapkan, protein bermigrasi melalui gel ke arah elektroda positif. Protein yang lebih kecil bergerak lebih cepat melalui pori-pori gel, sementara protein yang lebih besar bergerak lebih lambat.

Komponen Utama SDS-PAGE

1. Gel Poliakrilamida:
   • Resolving Gel
     Bagian gel utama untuk memisahkan protein berdasarkan berat molekul.
   • Stacking Gel
     Gel dengan konsentrasi rendah untuk memastikan semua protein mulai bermigrasi dari posisi yang sama.
2. Buffer SDS
   Buffer elektroforesis yang mengandung SDS menjaga lingkungan berisi ion untuk migrasi protein.
3. Marker Protein
   Digunakan sebagai referensi untuk menentukan ukuran relatif protein.
4. Pewarnaan Gel
   Setelah elektroforesis selesai, protein dalam gel divisualisasikan menggunakan pewarna sepertiCoomassie Brilliant Blue atau pewarnaan perak untuk meningkatkan sensitivitas.

Aplikasi SDS-PAGE

1. Penentuan Berat Molekul Protein
   SDS-PAGE memungkinkan perkiraan berat molekul protein dengan membandingkannya terhadap marker protein standar.
2. Analisis Kemurnian Protein
   Teknik ini dapat mendeteksi keberadaan protein target dalam sampel kompleks dan menentukan apakah protein tersebut telah dimurnikan sepenuhnya.
3. Studi Pasca-Translasi
   SDS-PAGE digunakan untuk mendeteksi modifikasi protein, seperti fosforilasi atau glikosilasi, dalam kombinasi dengan teknik tambahan.

Keunggulan SDS-PAGE

1. Resolusi Tinggi
   Memisahkan protein dengan tingkat akurasi yang sangat baik.
2. Efisien
   Memungkinkan analisis cepat dengan biaya yang relatif rendah.
3. Fleksibel
   Dapat digunakan untuk berbagai jenis protein, termasuk kompleks multikomponen.

Keterbatasan SDS-PAGE

1. Tidak dapat digunakan untuk memisahkan protein tanpa denaturasi, karena teknik ini melibatkan pemutusan struktur asli protein.
2. Tidak cocok untuk analisis protein dengan berat molekul sangat besar atau sangat kecil secara ekstrem.

Kesimpulan

SDS-PAGE adalah teknik elektroforesis yang sangat andal dan serbaguna untuk analisis protein, khususnya dalam memisahkan protein berdasarkan berat molekul. Dengan kemampuannya menghasilkan data yang presisi dan aplikasinya yang luas, SDS-PAGE tetap menjadi metode utama dalam penelitian biokimia, proteomik, dan bioteknologi.

Referensi: The Protein Protocols Handbook, John M. Walker, 1996